张文宏教授团队最新研讨！初次提醒不同长新冠亚型的多维组学分子特征全景
转自：上观新闻
近来，国家盛行症医学中心主任、复旦大学隶属华山医院感染科主任张文宏教授与复旦大学隶属华山医院感染科王森副主任医师作为通讯作者，艾静文副研讨员为榜首作者与一起通讯作者，郭晶鑫、林可、蔡建鹏、张昊澄及朱峰作为一起榜首作者，在《国家科学谈论》（National Science Review，NSR，中科院一区，影响因子16.3分）宣布题为“Integrated multi-omics characterization across clinically relevant subgroups of long COVID ”（《根据多组学联合剖析的长新冠临床亚分型特征》）的论文。
该研讨经过大规模的蛋白转录组及代谢组学的联合剖析，确认了长新冠不同临床亚型的多组学免疫代谢特征，找到了确诊生物标志物和潜在医治靶点。研讨立异性描绘了长新冠不同临床亚型之间的同质性及异质性的免疫代谢特色，为长新冠的临床诊治新思路供给了坚实的根底。
研讨布景
新冠病毒现在仍呈常态化盛行，长新冠等症状可长时间影响部分患者日子质量，带来较大公共卫生与社会经济负担。
新式冠状病毒感染现在已呈常态化盛行，虽然病毒感染症状一般只继续2-3周，但自2020年来，多个报导提示10%左右患者在急性期之后会阅历继续数月的呼吸困难、疲惫和脑雾等症状[1,2]，世界卫生组织界说其为新冠感染后归纳征，即长新冠。据报导，全球罹患长新冠的患者数量仍继续添加。长新冠症状可累及多个器官或体系，形成患者心思和精神妨碍关于部分患者更可严重影响患者日常日子，并导致其劳动力的损失，形成了巨大的公共卫生压力与社会经济负担。
本研讨团队自2022年启动了完好的长新冠多中心前瞻性行列研讨。经过对21826名初次感染新冠的患者的盛行病学及临床特征剖析，发现8.89%的患者在感染后 6个月报告了长新冠症状，且其间约20-30%左右患者的症状可在一年的时分继续存在[3]。因而，提醒这些长新冠症状的产生和继续背面的免疫机制具有较大研讨价值[3](Emerg Microbes Infect, 2023）。
免疫体系炎症活化可参加长新冠免疫损害效果，但机制不明
现在国际上普遍以为机体炎症活化及免疫失调是长新冠的首要免疫致病机制之一。其间，天然免疫及体液免疫通路的反常活泼在不同研讨中各有报导[4-8]。但和临床表型存在显着异质性相同，长新冠患者的免疫亚型也存在显着异质性[9-13]，这为研讨者深化了解疾病的致病机制形成了必定阻止。依照患者首要出现的临床症状区别，长新冠可分为神经长新冠、肺部长新冠、心血管体系长新冠以及体系性长新冠等。解析长新冠不同临床亚型的同质性和异质性免疫致病机制将有助于探究不同长新冠患者的特异性医治计划，并终究帮忙探究长新冠患者的准确办理。
研讨内容
在此之前，团队现已发现长新冠患者中心存在天然免疫通路的活化，且这些患者的临床炎症检测相关目标与长新冠临床和心思症状呈正相关（J Transl Med, 2024）。一起本研讨团队对免疫医治及抗病毒医治对长新冠发病的影响进行了开始评论（Clin Microbiol Infect,2024）。
在本研讨中，研讨团队经过包含转录组学、蛋白质组学和代谢组学在内的多组学整合剖析发现，长新冠患者全体出现 MAPK 通路激活增高，而康复的长新冠患者则表现出该反响的下调（图1）。长新冠的异质性特征在不同亚组中表现为多组学特异性标志：多体系（MULTI）症状亚组表现为甘油磷脂和醚类脂质代谢增强，神经（NEU）亚组表现为糖蛋白组成代谢添加，心脑（CACRB）亚组表现为丙酮酸代谢添加和巨噬细胞极化受抑，肌肉骨骼+体系性（MSK+SYST）亚组表现为甘油磷脂代谢增高，而心肺（CAPM）亚组则表现为 NF-κB 信号通路受抑。ABHD17A、CSNK1D、PSME4 和 SYVN1 可被选为确诊长新冠的潜在生物标志物，而 CRH（MULTI）、FPGT（NEU）、CBX6（CACRB）和 RBBP4（CAPM）则是各个相应亚组的血清特异性蛋白（图2）。该研讨供给了长新冠同质及亚组之间异质性的的病理生了解说，为未来的确诊和医治干涉奠定了根底。
评论和解读
本研讨报导了长新冠患者整体及不同临床亚型的大规模蛋白基因组学特征，包括转录组学、蛋白质组学、代谢组学和磷酸化蛋白质组学剖析。这些数据为进一步提醒临床表现同质性和异质性背面的免疫特征供给了名贵的资源，并促进针对特定亚组的免疫医治潜力探究。
从全球来看，长新冠症状在人群中表现出显着的临床和免疫异质性。本研讨中，一切长新冠患者不管亚组类别均表现出 MAPK 激活水平升高，而 MAPK 激活较强的患者症状继续时间更长，最长可达12个月。本研讨供给的信息再次提示长新冠的医治需求个体化的探究，临床需求经过分子生物学等手法，找到亟需干涉的患者，而不是针对一切自诉临床症状的患者进行干涉。
虽然全球科学界已开始达到共同，以为免疫失调是长新冠症状的首要潜在原因之一，但较少有研讨重视长新冠不同亚组之间一起的免疫特征。本研讨进一步经过结合转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学数据的多组学分类，识别了长新冠的5个共同免疫代谢亚组，与临床亚型相共同。本研讨还发现，肌肉骨骼+体系性（MSK+SYST）亚组和 神经（NEU ）亚组的一年缓解率低于其他亚组，提示这些症状的患者或许需求更长的康复期。这一发现与此前研讨发现的生物进程康复形式不同共同[13]。现在，阻止进一步机制研讨的一个妨碍是缺少长新冠动物模型。近期一项研讨成功建立了肺部病毒感染后遗症的小鼠模型，这或许极大地推进未来对潜在医治办法的探究[14, 15]。
本研讨根据大规模多组学行列，从临床以及归纳转录组、蛋白质组和代谢特征方面全面描绘了长新冠的同质性和异质性，提醒了没有彻底经过临床表现剖析捕捉到的长新冠各亚组的共有和共同分子与免疫机制，或许为开发个性化医治战略拓荒新途径，终究为临床实践带来好处。咱们期望本文中描绘的调查成果和剖析定论，经过提醒患者间同享和个性化的免疫特征，为长新冠的发病机制、发展和医治的深化研讨供给丰厚资源。
参考文献
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